Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NRG1Q02297 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRG1Q02297 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG1Q02297 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRG1Q02297 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms