Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F1Q01094 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F1Q01094 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms