Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUCB2P80303 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUCB2P80303 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB2P80303 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms