Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2FP61218 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR2FP61218 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2FP61218 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms