Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TMEM258P61165 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM258P61165 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TMEM258P61165 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TMEM258P61165 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TMEM258P61165 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TMEM258P61165 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TMEM258P61165 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMEM258P61165 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TMEM258P61165 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TMEM258P61165 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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TMEM258P61165 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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TMEM258P61165 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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TMEM258P61165 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM258P61165 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TMEM258P61165 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TMEM258P61165 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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