Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIK1P57059 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIK1P57059 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIK1P57059 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIK1P57059 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIK1P57059 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIK1P57059 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIK1P57059 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIK1P57059 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIK1P57059 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIK1P57059 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SIK1P57059 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIK1P57059 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIK1P57059 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIK1P57059 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIK1P57059 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIK1P57059 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIK1P57059 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIK1P57059 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIK1P57059 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIK1P57059 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIK1P57059 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIK1P57059 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SIK1P57059 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SIK1P57059 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SIK1P57059 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIK1P57059 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIK1P57059 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIK1P57059 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIK1P57059 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIK1P57059 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIK1P57059 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIK1P57059 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIK1P57059 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIK1P57059 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIK1P57059 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIK1P57059 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIK1P57059 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIK1P57059 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIK1P57059 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIK1P57059 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIK1P57059 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIK1P57059 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIK1P57059 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIK1P57059 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIK1P57059 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIK1P57059 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIK1P57059 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIK1P57059 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIK1P57059 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIK1P57059 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIK1P57059 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIK1P57059 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIK1P57059 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIK1P57059 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIK1P57059 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIK1P57059 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIK1P57059 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SIK1P57059 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIK1P57059 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIK1P57059 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIK1P57059 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIK1P57059 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIK1P57059 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIK1P57059 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIK1P57059 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SIK1P57059 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIK1P57059 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIK1P57059 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIK1P57059 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIK1P57059 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIK1P57059 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIK1P57059 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIK1P57059 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIK1P57059 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIK1P57059 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIK1P57059 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIK1P57059 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIK1P57059 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIK1P57059 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIK1P57059 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SIK1P57059 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIK1P57059 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIK1P57059 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIK1P57059 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIK1P57059 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIK1P57059 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIK1P57059 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIK1P57059 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIK1P57059 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIK1P57059 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIK1P57059 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIK1P57059 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIK1P57059 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIK1P57059 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIK1P57059 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIK1P57059 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIK1P57059 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIK1P57059 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIK1P57059 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms