Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CASP7P55210 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CASP7P55210 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CASP7P55210 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CASP7P55210 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CASP7P55210 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASP7P55210 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASP7P55210 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASP7P55210 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASP7P55210 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CASP7P55210 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASP7P55210 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CASP7P55210 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CASP7P55210 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CASP7P55210 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASP7P55210 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASP7P55210 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CASP7P55210 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CASP7P55210 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CASP7P55210 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CASP7P55210 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CASP7P55210 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CASP7P55210 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CASP7P55210 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CASP7P55210 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CASP7P55210 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CASP7P55210 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CASP7P55210 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CASP7P55210 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASP7P55210 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASP7P55210 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASP7P55210 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CASP7P55210 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASP7P55210 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASP7P55210 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CASP7P55210 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CASP7P55210 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CASP7P55210 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CASP7P55210 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CASP7P55210 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CASP7P55210 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CASP7P55210 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CASP7P55210 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CASP7P55210 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CASP7P55210 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CASP7P55210 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CASP7P55210 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CASP7P55210 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CASP7P55210 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CASP7P55210 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CASP7P55210 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CASP7P55210 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CASP7P55210 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CASP7P55210 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CASP7P55210 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CASP7P55210 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CASP7P55210 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CASP7P55210 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CASP7P55210 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CASP7P55210 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CASP7P55210 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CASP7P55210 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CASP7P55210 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CASP7P55210 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CASP7P55210 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CASP7P55210 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CASP7P55210 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CASP7P55210 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CASP7P55210 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CASP7P55210 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CASP7P55210 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CASP7P55210 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CASP7P55210 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CASP7P55210 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CASP7P55210 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CASP7P55210 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CASP7P55210 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CASP7P55210 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CASP7P55210 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CASP7P55210 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CASP7P55210 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CASP7P55210 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CASP7P55210 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CASP7P55210 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CASP7P55210 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CASP7P55210 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CASP7P55210 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CASP7P55210 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CASP7P55210 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CASP7P55210 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CASP7P55210 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CASP7P55210 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CASP7P55210 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASP7P55210 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASP7P55210 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASP7P55210 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASP7P55210 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASP7P55210 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASP7P55210 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASP7P55210 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms