Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELLP55199 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELLP55199 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELLP55199 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELLP55199 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELLP55199 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELLP55199 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELLP55199 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELLP55199 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELLP55199 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELLP55199 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELLP55199 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELLP55199 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ELLP55199 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELLP55199 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELLP55199 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELLP55199 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELLP55199 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELLP55199 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELLP55199 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELLP55199 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ELLP55199 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELLP55199 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELLP55199 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELLP55199 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ELLP55199 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELLP55199 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ELLP55199 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELLP55199 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELLP55199 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELLP55199 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELLP55199 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELLP55199 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ELLP55199 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ELLP55199 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ELLP55199 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELLP55199 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELLP55199 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELLP55199 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ELLP55199 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELLP55199 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELLP55199 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ELLP55199 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELLP55199 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELLP55199 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ELLP55199 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELLP55199 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ELLP55199 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ELLP55199 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELLP55199 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELLP55199 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELLP55199 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELLP55199 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELLP55199 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELLP55199 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ELLP55199 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ELLP55199 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ELLP55199 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ELLP55199 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ELLP55199 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ELLP55199 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ELLP55199 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ELLP55199 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ELLP55199 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ELLP55199 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ELLP55199 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ELLP55199 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ELLP55199 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ELLP55199 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ELLP55199 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ELLP55199 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ELLP55199 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ELLP55199 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ELLP55199 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ELLP55199 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ELLP55199 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ELLP55199 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ELLP55199 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ELLP55199 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms