Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRISP3P54108 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRISP3P54108 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms