Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACLYP53396 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACLYP53396 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACLYP53396 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACLYP53396 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACLYP53396 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACLYP53396 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACLYP53396 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACLYP53396 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACLYP53396 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACLYP53396 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACLYP53396 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACLYP53396 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACLYP53396 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACLYP53396 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACLYP53396 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACLYP53396 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACLYP53396 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACLYP53396 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ACLYP53396 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACLYP53396 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACLYP53396 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACLYP53396 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACLYP53396 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACLYP53396 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACLYP53396 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACLYP53396 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACLYP53396 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACLYP53396 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACLYP53396 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACLYP53396 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACLYP53396 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACLYP53396 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACLYP53396 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACLYP53396 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACLYP53396 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACLYP53396 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACLYP53396 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACLYP53396 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACLYP53396 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACLYP53396 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACLYP53396 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACLYP53396 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACLYP53396 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACLYP53396 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACLYP53396 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACLYP53396 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACLYP53396 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACLYP53396 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACLYP53396 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACLYP53396 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ACLYP53396 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACLYP53396 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACLYP53396 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACLYP53396 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACLYP53396 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACLYP53396 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACLYP53396 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ACLYP53396 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACLYP53396 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACLYP53396 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACLYP53396 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACLYP53396 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACLYP53396 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACLYP53396 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACLYP53396 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACLYP53396 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACLYP53396 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACLYP53396 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACLYP53396 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACLYP53396 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACLYP53396 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACLYP53396 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACLYP53396 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACLYP53396 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACLYP53396 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACLYP53396 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACLYP53396 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACLYP53396 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACLYP53396 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ACLYP53396 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACLYP53396 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACLYP53396 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACLYP53396 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACLYP53396 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACLYP53396 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACLYP53396 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACLYP53396 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ACLYP53396 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACLYP53396 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACLYP53396 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms