Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR8P51685 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR8P51685 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR8P51685 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR8P51685 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR8P51685 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR8P51685 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR8P51685 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR8P51685 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR8P51685 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR8P51685 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR8P51685 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR8P51685 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR8P51685 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR8P51685 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR8P51685 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR8P51685 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR8P51685 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR8P51685 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR8P51685 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR8P51685 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR8P51685 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR8P51685 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR8P51685 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR8P51685 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR8P51685 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR8P51685 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR8P51685 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR8P51685 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR8P51685 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR8P51685 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR8P51685 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR8P51685 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR8P51685 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR8P51685 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR8P51685 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR8P51685 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR8P51685 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR8P51685 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR8P51685 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR8P51685 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR8P51685 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR8P51685 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR8P51685 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR8P51685 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR8P51685 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR8P51685 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR8P51685 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR8P51685 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR8P51685 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR8P51685 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR8P51685 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR8P51685 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR8P51685 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR8P51685 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR8P51685 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR8P51685 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR8P51685 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR8P51685 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR8P51685 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR8P51685 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR8P51685 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR8P51685 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR8P51685 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR8P51685 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR8P51685 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR8P51685 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR8P51685 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR8P51685 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR8P51685 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR8P51685 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR8P51685 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR8P51685 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR8P51685 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR8P51685 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR8P51685 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR8P51685 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR8P51685 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR8P51685 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCR8P51685 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR8P51685 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR8P51685 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR8P51685 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR8P51685 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR8P51685 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR8P51685 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR8P51685 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR8P51685 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR8P51685 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR8P51685 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR8P51685 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms