Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC3P51654 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC3P51654 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC3P51654 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC3P51654 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC3P51654 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC3P51654 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC3P51654 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC3P51654 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC3P51654 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC3P51654 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC3P51654 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC3P51654 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC3P51654 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC3P51654 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC3P51654 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC3P51654 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC3P51654 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC3P51654 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC3P51654 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GPC3P51654 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC3P51654 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC3P51654 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC3P51654 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC3P51654 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC3P51654 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPC3P51654 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPC3P51654 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPC3P51654 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC3P51654 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPC3P51654 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC3P51654 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC3P51654 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC3P51654 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC3P51654 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC3P51654 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC3P51654 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC3P51654 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC3P51654 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC3P51654 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC3P51654 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC3P51654 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC3P51654 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC3P51654 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPC3P51654 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC3P51654 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC3P51654 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC3P51654 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC3P51654 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC3P51654 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC3P51654 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC3P51654 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC3P51654 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC3P51654 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC3P51654 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC3P51654 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC3P51654 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC3P51654 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC3P51654 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC3P51654 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC3P51654 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC3P51654 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC3P51654 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC3P51654 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC3P51654 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC3P51654 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC3P51654 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC3P51654 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC3P51654 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC3P51654 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC3P51654 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC3P51654 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC3P51654 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC3P51654 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC3P51654 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC3P51654 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC3P51654 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPC3P51654 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC3P51654 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC3P51654 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC3P51654 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC3P51654 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC3P51654 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC3P51654 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC3P51654 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC3P51654 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC3P51654 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC3P51654 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC3P51654 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC3P51654 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC3P51654 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms