Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPINT3P49223 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms