Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASRP41180 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASRP41180 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASRP41180 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASRP41180 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASRP41180 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASRP41180 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASRP41180 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASRP41180 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASRP41180 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASRP41180 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASRP41180 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASRP41180 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASRP41180 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASRP41180 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASRP41180 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASRP41180 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASRP41180 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASRP41180 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASRP41180 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASRP41180 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASRP41180 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASRP41180 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASRP41180 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASRP41180 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASRP41180 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASRP41180 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASRP41180 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASRP41180 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASRP41180 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASRP41180 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASRP41180 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASRP41180 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASRP41180 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASRP41180 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASRP41180 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASRP41180 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASRP41180 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASRP41180 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASRP41180 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASRP41180 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASRP41180 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASRP41180 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASRP41180 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASRP41180 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASRP41180 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASRP41180 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASRP41180 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASRP41180 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASRP41180 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASRP41180 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASRP41180 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASRP41180 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASRP41180 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASRP41180 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASRP41180 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASRP41180 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASRP41180 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASRP41180 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASRP41180 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASRP41180 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASRP41180 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASRP41180 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASRP41180 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASRP41180 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASRP41180 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASRP41180 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASRP41180 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASRP41180 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASRP41180 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASRP41180 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASRP41180 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms