Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINF1P36955 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINF1P36955 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINF1P36955 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SERPINF1P36955 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINF1P36955 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINF1P36955 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINF1P36955 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINF1P36955 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINF1P36955 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINF1P36955 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINF1P36955 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERPINF1P36955 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms