Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA7P31268 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HOXA7P31268 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOXA7P31268 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA7P31268 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms