Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LTKP29376 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LTKP29376 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LTKP29376 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LTKP29376 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
LTKP29376 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
LTKP29376 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LTKP29376 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LTKP29376 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LTKP29376 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LTKP29376 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LTKP29376 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LTKP29376 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LTKP29376 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LTKP29376 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTKP29376 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTKP29376 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTKP29376 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTKP29376 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTKP29376 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTKP29376 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LTKP29376 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTKP29376 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTKP29376 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTKP29376 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTKP29376 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LTKP29376 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LTKP29376 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LTKP29376 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LTKP29376 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LTKP29376 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
LTKP29376 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
LTKP29376 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
LTKP29376 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
LTKP29376 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LTKP29376 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LTKP29376 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LTKP29376 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LTKP29376 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LTKP29376 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTKP29376 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTKP29376 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTKP29376 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTKP29376 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTKP29376 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
LTKP29376 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTKP29376 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTKP29376 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LTKP29376 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LTKP29376 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LTKP29376 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LTKP29376 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LTKP29376 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LTKP29376 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LTKP29376 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTKP29376 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTKP29376 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTKP29376 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTKP29376 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
LTKP29376 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTKP29376 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTKP29376 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LTKP29376 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LTKP29376 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LTKP29376 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LTKP29376 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LTKP29376 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LTKP29376 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LTKP29376 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
LTKP29376 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LTKP29376 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
LTKP29376 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LTKP29376 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LTKP29376 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
LTKP29376 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
LTKP29376 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LTKP29376 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LTKP29376 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LTKP29376 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LTKP29376 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LTKP29376 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LTKP29376 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LTKP29376 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LTKP29376 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LTKP29376 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LTKP29376 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LTKP29376 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LTKP29376 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LTKP29376 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LTKP29376 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LTKP29376 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LTKP29376 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LTKP29376 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LTKP29376 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LTKP29376 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LTKP29376 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LTKP29376 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LTKP29376 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
LTKP29376 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LTKP29376 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.4 ms