Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXP28300 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXP28300 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXP28300 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXP28300 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXP28300 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXP28300 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXP28300 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXP28300 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXP28300 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXP28300 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXP28300 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXP28300 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXP28300 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXP28300 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXP28300 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LOXP28300 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXP28300 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXP28300 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXP28300 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXP28300 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXP28300 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXP28300 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXP28300 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXP28300 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXP28300 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXP28300 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXP28300 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXP28300 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXP28300 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXP28300 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXP28300 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXP28300 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXP28300 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXP28300 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXP28300 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXP28300 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXP28300 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXP28300 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXP28300 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXP28300 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXP28300 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXP28300 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXP28300 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXP28300 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXP28300 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXP28300 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXP28300 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXP28300 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXP28300 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LOXP28300 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LOXP28300 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LOXP28300 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LOXP28300 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LOXP28300 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LOXP28300 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXP28300 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXP28300 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXP28300 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXP28300 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXP28300 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXP28300 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXP28300 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXP28300 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXP28300 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXP28300 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXP28300 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXP28300 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXP28300 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXP28300 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXP28300 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXP28300 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXP28300 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXP28300 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXP28300 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXP28300 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXP28300 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXP28300 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXP28300 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXP28300 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXP28300 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LOXP28300 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXP28300 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXP28300 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXP28300 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXP28300 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXP28300 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXP28300 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms