Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR2AP28223 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR2AP28223 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR2AP28223 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms