Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMB9P28065 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms