Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD27P26842 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD27P26842 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD27P26842 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD27P26842 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD27P26842 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD27P26842 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD27P26842 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD27P26842 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD27P26842 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD27P26842 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD27P26842 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CD27P26842 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD27P26842 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD27P26842 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD27P26842 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD27P26842 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CD27P26842 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD27P26842 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD27P26842 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD27P26842 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD27P26842 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD27P26842 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD27P26842 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD27P26842 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD27P26842 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD27P26842 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD27P26842 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD27P26842 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD27P26842 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD27P26842 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CD27P26842 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD27P26842 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD27P26842 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD27P26842 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD27P26842 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD27P26842 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD27P26842 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD27P26842 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD27P26842 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD27P26842 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD27P26842 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD27P26842 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD27P26842 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD27P26842 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD27P26842 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD27P26842 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD27P26842 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD27P26842 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD27P26842 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD27P26842 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD27P26842 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD27P26842 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD27P26842 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD27P26842 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD27P26842 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD27P26842 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD27P26842 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD27P26842 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD27P26842 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD27P26842 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD27P26842 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD27P26842 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD27P26842 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CD27P26842 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD27P26842 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD27P26842 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD27P26842 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD27P26842 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD27P26842 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD27P26842 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD27P26842 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD27P26842 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD27P26842 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD27P26842 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD27P26842 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD27P26842 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD27P26842 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD27P26842 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD27P26842 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD27P26842 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD27P26842 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms