Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTFP26441 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTFP26441 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTFP26441 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTFP26441 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTFP26441 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTFP26441 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTFP26441 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTFP26441 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTFP26441 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTFP26441 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTFP26441 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTFP26441 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTFP26441 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTFP26441 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTFP26441 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTFP26441 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTFP26441 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTFP26441 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTFP26441 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTFP26441 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTFP26441 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTFP26441 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTFP26441 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTFP26441 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTFP26441 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTFP26441 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTFP26441 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTFP26441 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTFP26441 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTFP26441 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTFP26441 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTFP26441 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTFP26441 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTFP26441 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTFP26441 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTFP26441 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTFP26441 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTFP26441 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTFP26441 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTFP26441 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTFP26441 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTFP26441 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTFP26441 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTFP26441 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTFP26441 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTFP26441 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTFP26441 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTFP26441 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTFP26441 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTFP26441 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTFP26441 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTFP26441 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTFP26441 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTFP26441 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTFP26441 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTFP26441 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTFP26441 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTFP26441 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTFP26441 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTFP26441 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTFP26441 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTFP26441 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTFP26441 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTFP26441 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTFP26441 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTFP26441 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTFP26441 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTFP26441 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTFP26441 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTFP26441 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTFP26441 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTFP26441 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTFP26441 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTFP26441 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTFP26441 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms