Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA4P25789 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA4P25789 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms