Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCP20941 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCP20941 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCP20941 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCP20941 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCP20941 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCP20941 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCP20941 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCP20941 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCP20941 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCP20941 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCP20941 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCP20941 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCP20941 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCP20941 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCP20941 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCP20941 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCP20941 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCP20941 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCP20941 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCP20941 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCP20941 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCP20941 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCP20941 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCP20941 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCP20941 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCP20941 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCP20941 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCP20941 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCP20941 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCP20941 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCP20941 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCP20941 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCP20941 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCP20941 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCP20941 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDCP20941 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PDCP20941 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDCP20941 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDCP20941 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDCP20941 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDCP20941 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDCP20941 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCP20941 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCP20941 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCP20941 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCP20941 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCP20941 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCP20941 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCP20941 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCP20941 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCP20941 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCP20941 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCP20941 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCP20941 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCP20941 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCP20941 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCP20941 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCP20941 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCP20941 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCP20941 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDCP20941 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCP20941 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCP20941 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCP20941 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCP20941 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCP20941 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCP20941 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCP20941 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCP20941 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCP20941 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCP20941 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCP20941 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCP20941 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCP20941 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCP20941 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDCP20941 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCP20941 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCP20941 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms