Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGA1P17096 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGA1P17096 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGA1P17096 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA1P17096 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA1P17096 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA1P17096 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA1P17096 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA1P17096 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA1P17096 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA1P17096 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA1P17096 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA1P17096 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms