Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB1P16220 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB1P16220 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB1P16220 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB1P16220 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB1P16220 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB1P16220 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB1P16220 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB1P16220 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB1P16220 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB1P16220 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB1P16220 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB1P16220 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB1P16220 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB1P16220 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB1P16220 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB1P16220 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB1P16220 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB1P16220 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB1P16220 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB1P16220 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB1P16220 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB1P16220 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB1P16220 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB1P16220 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB1P16220 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB1P16220 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB1P16220 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB1P16220 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB1P16220 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB1P16220 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB1P16220 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB1P16220 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB1P16220 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB1P16220 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB1P16220 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB1P16220 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB1P16220 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB1P16220 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB1P16220 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB1P16220 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB1P16220 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB1P16220 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB1P16220 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB1P16220 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB1P16220 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB1P16220 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB1P16220 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB1P16220 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB1P16220 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB1P16220 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CREB1P16220 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB1P16220 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB1P16220 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB1P16220 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB1P16220 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB1P16220 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB1P16220 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB1P16220 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB1P16220 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB1P16220 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB1P16220 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB1P16220 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB1P16220 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB1P16220 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB1P16220 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB1P16220 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB1P16220 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB1P16220 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB1P16220 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB1P16220 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB1P16220 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB1P16220 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB1P16220 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB1P16220 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB1P16220 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB1P16220 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB1P16220 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB1P16220 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB1P16220 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB1P16220 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB1P16220 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB1P16220 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB1P16220 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB1P16220 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB1P16220 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB1P16220 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB1P16220 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms