Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALM3P0DP25 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALM3P0DP25 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALM3P0DP25 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALM3P0DP25 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALM3P0DP25 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALM3P0DP25 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms