Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf89P0DMQ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf89P0DMQ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf89P0DMQ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf89P0DMQ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf89P0DMQ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms