Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3L1P0CL83 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STAG3L1P0CL83 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STAG3L1P0CL83 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG3L1P0CL83 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms