Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF853P0CG23 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF853P0CG23 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF853P0CG23 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF853P0CG23 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF853P0CG23 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF853P0CG23 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF853P0CG23 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF853P0CG23 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF853P0CG23 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF853P0CG23 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms