Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP1P09874 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP1P09874 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP1P09874 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP1P09874 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP1P09874 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP1P09874 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARP1P09874 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP1P09874 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP1P09874 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP1P09874 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP1P09874 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP1P09874 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP1P09874 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP1P09874 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP1P09874 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP1P09874 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP1P09874 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARP1P09874 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP1P09874 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP1P09874 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARP1P09874 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PARP1P09874 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP1P09874 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARP1P09874 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP1P09874 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP1P09874 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP1P09874 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP1P09874 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARP1P09874 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP1P09874 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP1P09874 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP1P09874 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP1P09874 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARP1P09874 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP1P09874 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP1P09874 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARP1P09874 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP1P09874 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP1P09874 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP1P09874 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP1P09874 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP1P09874 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP1P09874 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP1P09874 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARP1P09874 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PARP1P09874 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP1P09874 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP1P09874 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP1P09874 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP1P09874 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP1P09874 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP1P09874 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARP1P09874 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP1P09874 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP1P09874 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP1P09874 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP1P09874 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP1P09874 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP1P09874 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP1P09874 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARP1P09874 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP1P09874 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP1P09874 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP1P09874 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP1P09874 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP1P09874 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP1P09874 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARP1P09874 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARP1P09874 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP1P09874 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP1P09874 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP1P09874 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP1P09874 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP1P09874 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP1P09874 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP1P09874 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP1P09874 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PARP1P09874 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP1P09874 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP1P09874 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP1P09874 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP1P09874 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP1P09874 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP1P09874 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP1P09874 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PARP1P09874 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP1P09874 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PARP1P09874 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP1P09874 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP1P09874 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms