Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
VIL1P09327 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VIL1P09327 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VIL1P09327 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VIL1P09327 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VIL1P09327 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VIL1P09327 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VIL1P09327 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VIL1P09327 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VIL1P09327 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VIL1P09327 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VIL1P09327 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VIL1P09327 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VIL1P09327 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VIL1P09327 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VIL1P09327 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VIL1P09327 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VIL1P09327 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VIL1P09327 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VIL1P09327 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VIL1P09327 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VIL1P09327 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VIL1P09327 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VIL1P09327 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
VIL1P09327 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VIL1P09327 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VIL1P09327 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VIL1P09327 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VIL1P09327 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VIL1P09327 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VIL1P09327 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VIL1P09327 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VIL1P09327 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VIL1P09327 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VIL1P09327 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VIL1P09327 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VIL1P09327 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VIL1P09327 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VIL1P09327 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
VIL1P09327 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VIL1P09327 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VIL1P09327 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VIL1P09327 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VIL1P09327 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VIL1P09327 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VIL1P09327 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VIL1P09327 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VIL1P09327 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VIL1P09327 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VIL1P09327 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VIL1P09327 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VIL1P09327 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VIL1P09327 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VIL1P09327 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VIL1P09327 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VIL1P09327 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VIL1P09327 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VIL1P09327 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VIL1P09327 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VIL1P09327 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VIL1P09327 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VIL1P09327 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VIL1P09327 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VIL1P09327 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VIL1P09327 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VIL1P09327 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VIL1P09327 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VIL1P09327 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VIL1P09327 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VIL1P09327 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VIL1P09327 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VIL1P09327 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VIL1P09327 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VIL1P09327 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VIL1P09327 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VIL1P09327 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VIL1P09327 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VIL1P09327 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VIL1P09327 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VIL1P09327 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VIL1P09327 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VIL1P09327 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VIL1P09327 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VIL1P09327 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VIL1P09327 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VIL1P09327 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VIL1P09327 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VIL1P09327 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VIL1P09327 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VIL1P09327 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VIL1P09327 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VIL1P09327 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VIL1P09327 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VIL1P09327 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VIL1P09327 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VIL1P09327 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VIL1P09327 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VIL1P09327 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VIL1P09327 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VIL1P09327 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms