Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP3P08254 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP3P08254 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP3P08254 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP3P08254 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP3P08254 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP3P08254 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP3P08254 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP3P08254 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP3P08254 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP3P08254 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP3P08254 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP3P08254 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP3P08254 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP3P08254 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP3P08254 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP3P08254 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP3P08254 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP3P08254 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP3P08254 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP3P08254 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP3P08254 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP3P08254 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP3P08254 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP3P08254 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP3P08254 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP3P08254 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP3P08254 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP3P08254 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP3P08254 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP3P08254 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP3P08254 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP3P08254 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP3P08254 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP3P08254 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP3P08254 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP3P08254 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP3P08254 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP3P08254 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP3P08254 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP3P08254 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP3P08254 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP3P08254 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP3P08254 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP3P08254 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP3P08254 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP3P08254 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP3P08254 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP3P08254 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP3P08254 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP3P08254 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP3P08254 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP3P08254 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP3P08254 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP3P08254 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP3P08254 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP3P08254 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP3P08254 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP3P08254 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP3P08254 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP3P08254 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP3P08254 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP3P08254 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP3P08254 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP3P08254 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP3P08254 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP3P08254 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP3P08254 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP3P08254 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP3P08254 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP3P08254 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP3P08254 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP3P08254 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP3P08254 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP3P08254 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP3P08254 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP3P08254 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP3P08254 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP3P08254 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP3P08254 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP3P08254 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP3P08254 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP3P08254 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP3P08254 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP3P08254 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMP3P08254 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMP3P08254 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP3P08254 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP3P08254 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP3P08254 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP3P08254 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms