Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRAP08240 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRPRAP08240 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPRAP08240 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms