Protein–RNA interactions for Protein: P00441

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1P00441 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD1P00441 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD1P00441 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD1P00441 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD1P00441 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOD1P00441 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD1P00441 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD1P00441 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD1P00441 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD1P00441 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD1P00441 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD1P00441 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOD1P00441 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOD1P00441 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOD1P00441 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOD1P00441 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOD1P00441 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOD1P00441 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOD1P00441 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOD1P00441 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOD1P00441 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOD1P00441 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOD1P00441 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOD1P00441 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOD1P00441 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD1P00441 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD1P00441 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD1P00441 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD1P00441 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD1P00441 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD1P00441 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD1P00441 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD1P00441 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD1P00441 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOD1P00441 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOD1P00441 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOD1P00441 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOD1P00441 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOD1P00441 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOD1P00441 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOD1P00441 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD1P00441 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD1P00441 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD1P00441 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD1P00441 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD1P00441 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD1P00441 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD1P00441 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD1P00441 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD1P00441 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOD1P00441 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOD1P00441 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOD1P00441 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOD1P00441 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOD1P00441 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOD1P00441 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOD1P00441 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOD1P00441 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOD1P00441 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SOD1P00441 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOD1P00441 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOD1P00441 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOD1P00441 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOD1P00441 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD1P00441 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD1P00441 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD1P00441 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD1P00441 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD1P00441 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD1P00441 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD1P00441 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOD1P00441 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOD1P00441 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOD1P00441 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOD1P00441 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD1P00441 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD1P00441 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD1P00441 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD1P00441 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD1P00441 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD1P00441 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD1P00441 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD1P00441 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms