Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHEK2O96017 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHEK2O96017 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHEK2O96017 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms