Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTLL1O95922 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL1O95922 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL1O95922 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL1O95922 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms