Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf47O95873 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C6orf47O95873 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms