Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDST3O95803 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDST3O95803 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDST3O95803 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDST3O95803 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDST3O95803 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDST3O95803 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDST3O95803 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDST3O95803 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDST3O95803 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDST3O95803 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDST3O95803 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDST3O95803 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDST3O95803 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDST3O95803 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDST3O95803 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDST3O95803 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDST3O95803 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDST3O95803 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDST3O95803 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDST3O95803 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDST3O95803 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDST3O95803 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDST3O95803 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDST3O95803 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDST3O95803 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NDST3O95803 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDST3O95803 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDST3O95803 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDST3O95803 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDST3O95803 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDST3O95803 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NDST3O95803 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDST3O95803 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDST3O95803 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDST3O95803 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDST3O95803 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDST3O95803 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDST3O95803 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDST3O95803 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDST3O95803 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDST3O95803 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDST3O95803 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDST3O95803 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDST3O95803 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDST3O95803 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDST3O95803 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDST3O95803 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NDST3O95803 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDST3O95803 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDST3O95803 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NDST3O95803 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST3O95803 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST3O95803 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST3O95803 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST3O95803 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST3O95803 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST3O95803 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST3O95803 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST3O95803 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST3O95803 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST3O95803 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST3O95803 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST3O95803 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST3O95803 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST3O95803 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST3O95803 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST3O95803 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST3O95803 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDST3O95803 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDST3O95803 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST3O95803 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST3O95803 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST3O95803 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST3O95803 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST3O95803 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST3O95803 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST3O95803 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST3O95803 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST3O95803 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST3O95803 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST3O95803 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST3O95803 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST3O95803 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST3O95803 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST3O95803 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST3O95803 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST3O95803 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST3O95803 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST3O95803 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST3O95803 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms