Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF1O95521 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF1O95521 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms