Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSO75390 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSO75390 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSO75390 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSO75390 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSO75390 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSO75390 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSO75390 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSO75390 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSO75390 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSO75390 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSO75390 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSO75390 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSO75390 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSO75390 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSO75390 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSO75390 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSO75390 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSO75390 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSO75390 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSO75390 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSO75390 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSO75390 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSO75390 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSO75390 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSO75390 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSO75390 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSO75390 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSO75390 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSO75390 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSO75390 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSO75390 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSO75390 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSO75390 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSO75390 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSO75390 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSO75390 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSO75390 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSO75390 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSO75390 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSO75390 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSO75390 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSO75390 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSO75390 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSO75390 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSO75390 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSO75390 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSO75390 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CSO75390 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSO75390 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSO75390 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSO75390 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSO75390 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSO75390 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSO75390 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSO75390 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSO75390 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSO75390 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSO75390 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSO75390 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSO75390 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSO75390 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSO75390 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSO75390 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSO75390 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSO75390 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSO75390 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSO75390 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSO75390 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSO75390 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSO75390 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSO75390 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CSO75390 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSO75390 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSO75390 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSO75390 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSO75390 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSO75390 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSO75390 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSO75390 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSO75390 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSO75390 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSO75390 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSO75390 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSO75390 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSO75390 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSO75390 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSO75390 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSO75390 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSO75390 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSO75390 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms