Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
BRD4O60885 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BRD4O60885 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BRD4O60885 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BRD4O60885 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
BRD4O60885 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRD4O60885 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRD4O60885 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRD4O60885 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRD4O60885 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRD4O60885 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRD4O60885 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRD4O60885 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRD4O60885 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRD4O60885 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRD4O60885 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRD4O60885 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRD4O60885 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
BRD4O60885 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BRD4O60885 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BRD4O60885 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BRD4O60885 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BRD4O60885 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BRD4O60885 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRD4O60885 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRD4O60885 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BRD4O60885 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRD4O60885 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRD4O60885 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRD4O60885 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRD4O60885 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRD4O60885 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRD4O60885 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRD4O60885 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRD4O60885 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRD4O60885 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRD4O60885 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRD4O60885 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BRD4O60885 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRD4O60885 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRD4O60885 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRD4O60885 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRD4O60885 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRD4O60885 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRD4O60885 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRD4O60885 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRD4O60885 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRD4O60885 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRD4O60885 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRD4O60885 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRD4O60885 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRD4O60885 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRD4O60885 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRD4O60885 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRD4O60885 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRD4O60885 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRD4O60885 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRD4O60885 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRD4O60885 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRD4O60885 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRD4O60885 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRD4O60885 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRD4O60885 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRD4O60885 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
BRD4O60885 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRD4O60885 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRD4O60885 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRD4O60885 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRD4O60885 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRD4O60885 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRD4O60885 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRD4O60885 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRD4O60885 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRD4O60885 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRD4O60885 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRD4O60885 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRD4O60885 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BRD4O60885 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BRD4O60885 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BRD4O60885 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
BRD4O60885 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BRD4O60885 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
BRD4O60885 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.82■■■■□ 3
BRD4O60885 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BRD4O60885 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.81■■■■□ 3
BRD4O60885 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BRD4O60885 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BRD4O60885 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BRD4O60885 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.8■■■■□ 3
BRD4O60885 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.2 ms