Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA5O60264 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMARCA5O60264 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms