Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DHX16O60231 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DHX16O60231 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DHX16O60231 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DHX16O60231 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DHX16O60231 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DHX16O60231 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DHX16O60231 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DHX16O60231 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DHX16O60231 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DHX16O60231 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DHX16O60231 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DHX16O60231 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DHX16O60231 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DHX16O60231 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DHX16O60231 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DHX16O60231 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DHX16O60231 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DHX16O60231 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DHX16O60231 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DHX16O60231 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DHX16O60231 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DHX16O60231 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DHX16O60231 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DHX16O60231 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DHX16O60231 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DHX16O60231 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DHX16O60231 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DHX16O60231 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DHX16O60231 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DHX16O60231 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DHX16O60231 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DHX16O60231 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DHX16O60231 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DHX16O60231 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DHX16O60231 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DHX16O60231 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DHX16O60231 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DHX16O60231 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX16O60231 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX16O60231 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX16O60231 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX16O60231 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX16O60231 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX16O60231 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX16O60231 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX16O60231 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX16O60231 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX16O60231 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX16O60231 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX16O60231 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX16O60231 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX16O60231 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX16O60231 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX16O60231 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX16O60231 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX16O60231 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX16O60231 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX16O60231 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX16O60231 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX16O60231 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX16O60231 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX16O60231 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX16O60231 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX16O60231 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX16O60231 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX16O60231 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX16O60231 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX16O60231 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
DHX16O60231 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX16O60231 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX16O60231 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX16O60231 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX16O60231 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX16O60231 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX16O60231 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX16O60231 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DHX16O60231 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DHX16O60231 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DHX16O60231 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DHX16O60231 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DHX16O60231 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DHX16O60231 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DHX16O60231 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DHX16O60231 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DHX16O60231 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DHX16O60231 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DHX16O60231 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DHX16O60231 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DHX16O60231 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DHX16O60231 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DHX16O60231 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DHX16O60231 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DHX16O60231 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DHX16O60231 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DHX16O60231 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DHX16O60231 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DHX16O60231 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DHX16O60231 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DHX16O60231 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms