Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRICKLE3O43900 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRICKLE3O43900 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRICKLE3O43900 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms