Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDELR3O43731 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDELR3O43731 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR3O43731 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms