Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF103O00237 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF103O00237 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF103O00237 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF103O00237 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF103O00237 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF103O00237 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF103O00237 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF103O00237 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF103O00237 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF103O00237 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF103O00237 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF103O00237 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF103O00237 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF103O00237 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF103O00237 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF103O00237 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF103O00237 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF103O00237 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF103O00237 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF103O00237 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF103O00237 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF103O00237 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF103O00237 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF103O00237 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF103O00237 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF103O00237 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF103O00237 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF103O00237 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF103O00237 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF103O00237 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF103O00237 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF103O00237 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF103O00237 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF103O00237 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF103O00237 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF103O00237 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF103O00237 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF103O00237 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF103O00237 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF103O00237 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF103O00237 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF103O00237 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF103O00237 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF103O00237 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF103O00237 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF103O00237 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF103O00237 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF103O00237 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF103O00237 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF103O00237 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF103O00237 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF103O00237 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF103O00237 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF103O00237 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF103O00237 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF103O00237 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF103O00237 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF103O00237 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF103O00237 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF103O00237 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF103O00237 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF103O00237 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF103O00237 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF103O00237 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF103O00237 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF103O00237 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF103O00237 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF103O00237 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF103O00237 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF103O00237 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF103O00237 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF103O00237 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF103O00237 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF103O00237 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF103O00237 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF103O00237 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF103O00237 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF103O00237 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF103O00237 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF103O00237 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF103O00237 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF103O00237 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF103O00237 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF103O00237 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF103O00237 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF103O00237 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF103O00237 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF103O00237 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF103O00237 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF103O00237 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF103O00237 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF103O00237 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF103O00237 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF103O00237 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF103O00237 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF103O00237 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF103O00237 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF103O00237 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF103O00237 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms