Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPA2E9PIF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA2E9PIF3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms