Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLRF2D3W0D1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KLRF2D3W0D1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLRF2D3W0D1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLRF2D3W0D1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms