Protein–RNA interactions for Protein: A8MYZ0

MINDY4B, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4B, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4BA8MYZ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MINDY4BA8MYZ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MINDY4BA8MYZ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MINDY4BA8MYZ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms